Suatu hari, Hotaru Yuyami yang bekerja sebagai penulis buku gambar ini mendapati sesuatu yang mirip dengan jamur berwarna merah mudah di taman. Menariknya, benda yang ia lihat tersebut tiba-tiba bergerak.Awalnya, ia mengira benda tersebut merupakan tanaman. Namun, ia menyadari bahwa itu merupakan seekor anjing. Hotaru pun memutuskan untuk merawatnya dan kini kehidupan Hotaru Bersama Kinoko Inu telah dimulai.